其中，江苏有9所高校的16个项目获奖：
（以第一单位来看）
南京理工大学：（两项）
王泽山院士主持的“某发射能源项目”获国家技术发明一等奖
技术发明二等奖一项
河海大学：（两项）
王沛芳教授主持的“生态节水型灌区建设关键技术及应用”获国家科技进步一等奖
技术发明二等奖一项
南京大学：（四项）
自然科学二等奖一项
技术发明二等奖一项
科技进步二等奖两项
东南大学：（三项）
自然科学二等奖一项
技术发明二等奖一项
科技进步二等奖一项
南京航空航天大学：（一项）
技术发明二等奖一项
中国矿业大学、中国药科大学、苏州大学、南京林业大学：（各一项）
各获科技进步二等奖一项
“三冠王”、“冷专业”、“80后”
中国工程院院士、南京理工大学教授王泽山及其团队——获2016年度国家技术发明一等奖
1954年抗美援朝的硝烟刚刚散去，19岁的王泽山怀揣着兴国强军的梦想，进入哈尔滨军事工程学院学习，选择了全校最冷僻的火炸药专业。
中国工程院院士 南京理工大学教授 王泽山
最差的就是这个火药炸药专业，没有任何人报。有些公认最好的，对我也不一定是最好，但我感觉在这上面，我能有所发展。我不认为有些人看那个地方，工资多、钱多，就选那个，不一定是最恰当的。
长期的专研和付出，王泽山成了我国火炸药科研领域的领军人物。1993年，他开辟和发展了“退役含能材料治理和资源化利用”的新途径，获国家科技进步一等奖；1996年，又凭借着低温感含能技术，获国家技术发明一等奖。他又把目光瞄向了另一个国际军械领域长期无法解决的世界性难题，用了20年时间，另辟蹊径创立了装药新技术和相应的弹道理论，终于研发出了火炮只需用一种操作模块即可覆盖全射程的装药技术。凭借这一成果，王泽山再次问鼎2016年度国家技术发明一等奖。
作为国内为数不多摘得三项国家最高科技大奖桂冠的“三冠王”，王泽山不断创新的秘诀究竟是什么呢？
中国工程院院士 南京理工大学教授 王泽山
不能吃别人嚼过的馍，跟着人家，你做啥，我做啥，你永远在人家之下。我们搞创新必须要这样，必须要有一个超越，你能做到，我能做到，你做不到，我还能做到。
王泽山院士今年已81岁高龄，却是个标准的“80后”：他精力充沛，每天开车上下班，走路爬楼健步如飞，一年中一半的时间在野外试验场地工作；他头脑灵活，能熟练操作各种数码产品，做电脑flash，做漂亮的PPT，通过手机app买车票、订宾馆、叫出租，用微信和学生交流。
中国工程院院士 南京理工大学教授 王泽山
我们应该前进，要走在前面，这是一种责任心，也是对国家的一种贡献。尤其是武器，真是走在世界的前面，那个威慑的力量，那是很大的，所以这是一种追求。
“抗癌药”、“美国FDA”、“52个亿”
中国药科大学尤启冬教授及其团队——获2016年度国家科技进步二等奖
早在上世纪90年代，中国药科大学尤启冬教授的研究团队率先和知名药企恒瑞医药共建“新药研发实验室”，双方第一个合作项目是抗肠癌药物——伊立替康的产业化研究，当时，该药物主要依赖国外进口。
中国药科大学教授尤启冬
联手的过程中怎样去选题，要适销对路，要能够解决老百姓的实际需要，因此当时选择了伊立替康，它是世界上第一个批准用于治疗肠癌的新药。
针对伊立替康产业化过程中副产物多、分离纯化困难等问题，研究团队历时7年时间，自主研发出了合成技术和产品纯化新工艺，在全国首家获得伊立替康新药证书，目前，该产品在国内同类药品中市场占有率达60%。2010年，它通过了美国FDA即食品药品管理局的认证，成为我国第一个进入美国市场的注射剂。
尤启冬教授带领团队又在全国首个将长春瑞滨研发上市，它主要用于治疗肺癌、乳腺癌等，长春瑞滨也成为第二个通过美国FDA认证的注射剂。
这两个药品开创了我国注射剂药品进入世界发达国家市场的先河，累计销售52亿元，创汇1200万美元。不过，研究团队不满足于只是工艺上的创新，他们的目标是要做中国真正的原创药。由尤启冬教授牵头组建“江苏省药物分子设计与成药性优化重点实验室”，以天然产物为研究核心，这源于现有抗肿瘤药物中有近80%的药物都来自天然产物。正在研发的藤黄酸、黄芩素、汉黄芩素3个新药已拥有10项国家发明专利，实现了“由仿制药到创新药”的跨越。
中国药科大学教授尤启冬
我们要有一个理念，怎样去把这些科技成果能够尽可能地转化成现实的药品，怎样去为经济社会服务，高校要发挥它的优势，在科学前沿的优势，在技术方面的优势。
其他高校获奖一睹为快
东南大学参与的4G项目——获科技进步特等奖
